Super Micro navigiert auch durch eine rechtliche Kontroverse. Eine Bundesanklage aus dem südlichen Bezirk von New York beschuldigte nicht genannte Personen, die mit einem unidentifizierten US-Serverunternehmen in Verbindung stehen, Milliarden von Dollar in Nvidia $NVDA-ausgestattete Server nach China geschmuggelt zu haben, was gegen Exportkontrollen verstößt. Super Micro erkannte an, dass drei der angeklagten Personen Verbindungen zu dem Unternehmen hatten, darunter Mitbegründer Yih-Shyan "Wally" Liaw, der seitdem den Vorstand verlassen hat. Das Unternehmen sagt, es erwarte nicht, die zuvor gemeldeten Finanzergebnisse neu darzustellen.